Universal Sequencing TELL-Seq စာကြည့်တိုက်
သတ်မှတ်ချက်များ
- ထုတ်ကုန်အမည်- TELL-SeqTM Library Sequencing Kit
- ထုတ်လုပ်သူ- Universal Sequencing Technology Corporation
- လိုက်ဖက်ညီမှု- iSeq 100 မှလွဲ၍ Illumina sequencing စနစ်များအားလုံး
- ရည်ရွယ်အသုံးပြုခြင်း- ရောဂါရှာဖွေရေးလုပ်ထုံးလုပ်နည်းများအတွက် မဟုတ်ဘဲ သုတေသနအတွက်သာ အသုံးပြုပါ။
- ပြန်လည်ပြင်ဆင်မှုမှတ်တမ်း- ဗားရှင်း 7.0၊ သြဂုတ် 2024
ထုတ်ကုန်အသုံးပြုမှု ညွှန်ကြားချက်များ-
နိဒါန်း
TELL-SeqTM စာကြည့်တိုက်တွင် မည်သည့် Illumina စီစစ်ခြင်းစနစ်များအတွက် စိတ်ကြိုက် sequencing primers လိုအပ်ပြီး ချိတ်ဆက်ထားသော reads အတွက် မော်လီကျူးဘားကုဒ်အဖြစ် အသုံးပြုသည့် 18-base အညွှန်း 1 sequence ပါရှိပါသည်။
Kit Contents
| အစိတ်အပိုင်းအမည် | ဦးထုပ်အရောင် | အာရုံစူးစိုက်မှု | ပမာဏ (µL) |
|---|---|---|---|
| Primer 1 ကိုဖတ်ပါ။ | CAP Black | 100M | 50 |
| Primer 2 ကိုဖတ်ပါ။ | CAP အဖြူရောင် | 100M | 50 |
| အညွှန်း 1 Primer | CAP အနီရောင် | 100M | 50 |
| အညွှန်း 2 Primer | CAP အဝါရောင် | 100M | 50 |
TELL-SeqTM Library Structure နှင့် Sequencing Scheme
- အညွှန်း 1 (I7 အညွှန်း) တွင် 18-base TELL Bead sequence များ ပါရှိသည်။
- Index 2 (I5 index) တွင် s ပါရှိသည်။ampစာကြည့်တိုက်တွင်အသုံးပြုသော le index primer sequences amplification ။
- အနိမ့်ဆုံးဖတ်ရန်အရှည်လိုအပ်ချက် 2×96 နှင့် အများဆုံးဖတ်သည့်အရှည်လိုအပ်ချက် 2×150 ဖြင့် တွဲထားသော အဆုံးအတွဲလိုက်ခြင်းကို ဦးစားပေးသည်။
- ဒစ်ဂျစ်တိုက်တွင် မတူညီသော multiplex primer ကိုအသုံးပြုသည့်အခါ စီတန်းခြင်းအတွက် စာကြည့်တိုက်များကို စုစည်းနိုင်သည်။ amplification အဆင့်။
စိတ်ကြိုက် Sequencing Primers
TELL-SeqTM စာကြည့်တိုက်များကို စီစစ်ရန်အတွက် စိတ်ကြိုက် sequencing primer များကို TELL-SeqTM Illumina Sequencing Primer Kit တွင် ပံ့ပိုးပေးပါသည်။
စိတ်ကြိုက် အညွှန်း 2 Primer
ကွဲပြားသော multiplex primer များပါရှိသော TELL-SeqTM စာကြည့်တိုက်များကို ဆက်တိုက်ပြုလုပ်ရန် နှင့် sequencer တစ်ခုသည် i2 အညွှန်းကိန်း စီစီစဉ် primer လိုအပ်သည့်အခါ စိတ်ကြိုက် Index 5 primer လိုအပ်ပါသည်။ လက်ရှိတွင်၊ MiSeq အတွက်သာ၊ စိတ်ကြိုက် Index 2 Primer မလိုအပ်ပါ။
အမေးများသောမေးခွန်းများ (FAQ)
- မေး။
A- မဟုတ်ပါ၊ TELL-SeqTM အစုံသည် သုတေသနအသုံးပြုရန်အတွက်သာဖြစ်ပြီး ရောဂါရှာဖွေရေးလုပ်ငန်းစဉ်များအတွက် အသုံးမပြုသင့်ပါ။ - မေး- တွဲထားသော အဆုံးအတွဲလိုက်အတွက် အနိမ့်ဆုံးနှင့် အများဆုံး ဖတ်ရှုရမည့် အရှည် လိုအပ်ချက်မှာ အဘယ်နည်း။
A- အနိမ့်ဆုံးဖတ်ရန်အရှည် လိုအပ်ချက်မှာ 2×96 ဖြစ်ပြီး တွဲထားသော အဆုံးအတွဲလိုက်အတွက် အများဆုံးဖတ်ရန်အရှည် လိုအပ်ချက်မှာ 2×150 ဖြစ်သည်။
TELL-Seq™ Library Sequencing အသုံးပြုသူလမ်းညွှန်
iSeq 100 မှလွဲ၍ Illumina@ sequencing စနစ်များအားလုံးအတွက်
သုတေသနအတွက်သာ အသုံးပြုရန်။ ရောဂါရှာဖွေရေးလုပ်ငန်းစဉ်များတွင် အသုံးပြုရန်မဟုတ်ပါ။
စာရွက်စာတမ်း #100018 v7.0
သြဂုတ် 2024
ဤစာရွက်စာတမ်းသည် Universal Sequencing Technology Corporation ၏ မူပိုင်ဖြစ်ပြီး ဤနေရာတွင်ဖော်ပြထားသော ထုတ်ကုန်များကို အသုံးပြုခြင်းနှင့် အခြားရည်ရွယ်ချက်များအတွက် အသုံးပြုခြင်းနှင့်ပတ်သက်၍ ၎င်း၏ဖောက်သည်အသုံးပြုရန်အတွက်သာ ရည်ရွယ်ပါသည်။
TELL-Seq™ kit ကို သင့်လျော်ပြီး ဘေးကင်းစွာ အသုံးပြုကြောင်း သေချာစေရန်အတွက် ဤစာရွက်စာတမ်းပါ ညွှန်ကြားချက်များကို စနစ်တကျ လေ့ကျင့်ထားသော ဝန်ထမ်းများမှ တိကျစွာ လိုက်နာရပါမည်။
UNIVERSAL SEQUENCING TECHNOLOGY သည် TELL-SEQ™ KIT ကို မှားယွင်းစွာအသုံးပြုပြီးနောက် ဖြစ်ပေါ်လာသည့်တာဝန်ဝတ္တရားတစ်စုံတစ်ရာကို မယူဆပါ။
©2022 Universal Sequencing Technology Corporation မူပိုင်ခွင့်ကိုလက်ဝယ်ထားသည်။
TELL-Seq™ သည် Universal Sequencing Technology Corporation ၏ ကုန်အမှတ်တံဆိပ်တစ်ခုဖြစ်သည်။ အခြားအမည်များ၊ လိုဂိုများနှင့် အခြားကုန်အမှတ်တံဆိပ်များအားလုံးသည် သက်ဆိုင်ရာပိုင်ရှင်များ၏ ပိုင်ဆိုင်မှုဖြစ်သည်။
ပြန်လည်ပြင်ဆင်မှုမှတ်တမ်း
| စာရွက်စာတမ်း # | ဗားရှင်း | DCR အကိုးအကားနှင့် မှတ်ချက် |
| C01K002 Rev. A | ဇန်နဝါရီ 2020 | ကနဦးဖြန့်ချိမှု |
| C01K002 Rev. B | မတ်လ 2020 | နောက်ဆက်တွဲထည့်ပါ။ |
| 100018-USG | 3.0 | NovaSeq v1.5 ဓာတ်ပစ္စည်းများအတွက် လမ်းညွှန်ချက်ထည့်ပါ။ |
| 100018-USG | 4.0 | နောက်ဆုံးထွက် NovaSeq အတွက် အသေးစိတ် လမ်းညွှန်ချက်ကို ထည့်ပါ။
ဓာတ်ပစ္စည်းများ |
| 100018-USG | 5.0 | NextSeq 1000/2000 စနစ်အတွက် လမ်းညွှန်ကို ထည့်ပါ။ |
| 100018-USG | 6.0 | 96 Multiplex primers (C-series) အချက်အလက်ကို ထည့်ပါ။ |
| 100018-USG | 7.0 | 384 Multiplex primers (C၊D၊E၊F-series) ထည့်ပါ
အချက်အလက် Index 2 Primer အချက်အလက်ကို အပ်ဒိတ်လုပ်ပါ။ |
နိဒါန်း
ဤပရိုတိုကောသည် Illumina® sequencing စနစ်တွင် မည်သည့် အညွှန်းဖြင့် တွဲထားသည့် အဆုံး TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များကို မည်သို့လုပ်ဆောင်ရမည်ကို ရှင်းပြထားသည်။
TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်† သည် မည်သည့် Illumina စီစစ်ခြင်းစနစ်များအတွက် စိတ်ကြိုက် sequencing primers လိုအပ်ပြီး ချိတ်ဆက်ထားသော reads အတွက် မော်လီကျူးဘားကုဒ်အဖြစ် အသုံးပြုသည့် 18-base အညွှန်းကိန်း 1 sequence ပါရှိပါသည်။
Kit Contents
TELL-Seq™ Illumina® Sequencing Primer Kit (PN 100004)
TELL-Seq™ Illumina® Sequencing Primer Kit၊ HT (PN 100013)
TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်ဖွဲ့စည်းပုံနှင့် Sequencing အစီအစဉ်
အညွှန်း 1 (ဆိုလိုသည်မှာ၊ I7 အညွှန်း) တွင် 18-base TELL Bead sequence များ ပါ၀င်သည်၊ ၎င်းသည် လုံးလုံးလျားလျား စီစဥ်ထားရမည်ဖြစ်သည်။ အညွှန်း 2 (ဆိုလိုသည်မှာ I5 အညွှန်း) တွင် 8-base (T-series) သို့မဟုတ် 10-base (C-series) s ပါရှိသည်။ampစာကြည့်တိုက်တွင်အသုံးပြုသော le index primer sequences amplification တွဲထားသော အဆုံး အတွဲလိုက်ကို ဦးစားပေးသည်။ အနည်းဆုံးဖတ်ရန်အရှည်လိုအပ်ချက်မှာ 2×96; အများဆုံးဖတ်ရန်အရှည်လိုအပ်ချက်မှာ 2×150 ဖြစ်သည်။
Example of Illumina® Sequencing % Base by Cycle Chart
Illumina® Sequencing လမ်းညွှန်ချက်
- Illumina® sequencing platform တိကျသော အာရုံစူးစိုက်မှုနှင့် ပမာဏအရ TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်ကို မှေးမှိန်လိုက်ပါ။
- ဒစ်ဂျစ်တိုက်တွင် မတူညီသော multiplex primer ကိုအသုံးပြုသည့်အခါ အတွဲလိုက်များအတွက် စာကြည့်တိုက်များကို စုစည်းထားနိုင်သည်။ amplification အဆင့်။
- TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များကို စီစစ်ရန်နှင့် TELL-Seq™ Illumina Sequencing Primer Kit တွင် စိတ်ကြိုက် sequencing primer လိုအပ်ပါသည်။
- ဤစိတ်ကြိုက် primer များအတွက် သတ်မှတ်ထားသော ရေတွင်းများတွင် ဤစိတ်ကြိုက် sequencing primers များကို တင်နိုင်ပါသည်။ တနည်းအားဖြင့်၊ Illumina® PhiX ထိန်းချုပ်မှု စာကြည့်တိုက်ကို ဆက်တိုက်လည်ပတ်မှုတွင် အရှိန်မြှင့်လိုက်သောအခါ ၎င်းတို့ကို သက်ဆိုင်ရာ စံIllumina® sequencing primer wells များတွင်လည်း ထည့်သွင်းနိုင်သည်။
- ကွဲပြားသော multiplex primer များပါရှိသော TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များကို စိတ်ကြိုက်အညွှန်း 2 primer ကို စီစစ်ရန်အတွက် နှင့် sequencer တစ်ခုမှ i5 index sequencing primer လိုအပ်သည့်အခါမှသာ လိုအပ်ပါသည်။ လောလောဆယ် MiSeq အတွက်သာ၊ စိတ်ကြိုက် Index 2 Primer မလိုအပ်ပါ။ HiSeq 2000/2500 နှင့် NovaSeq v1 reagents ကဲ့သို့သော ပံ့ပိုးမထားသော စနစ်များအတွက်လည်း စိတ်ကြိုက် Index 2 primer မလိုအပ်ပါ။
- ပေးထားသော sequencing primers ပမာဏကို အသုံးပြု၍ sequencing run သည့် အနိမ့်ဆုံးအရေအတွက်ကို sequencing system ပေါ်အခြေခံ၍ ကွဲပြားပါသည်။
| Sequencing စနစ် | စိတ်ကြိုက် Index 2 Primer လိုအပ်ပါသလား။ |
| NovaSeq X/X Plus | ဟုတ်ကဲ့ |
| NovaSeq 6000 | ဟုတ်ကဲ့ |
| HiSeq 3000/4000 | ဟုတ်ကဲ့ |
| NextSeq | ဟုတ်ကဲ့ |
| MiSeq | မရှိ |
| MiniSeq | ဟုတ်ကဲ့ |
Exampသူတို့ကိုampMiSeq စနစ်အတွက် le Sheet
အောက်မှာ ရည်းစားဟောင်း ရှိတယ်။ampအဆိုပါamp2-cycle အညွှန်း 146 (ဆိုလိုသည်မှာ I18 အညွှန်း) နှင့် 1-cycle သို့မဟုတ် 7-base (C-series) အညွှန်း 8 (ဆိုလိုသည်မှာ၊ I10 အညွှန်းကိန်း) ဖြင့် လည်ပတ်နေသော 2×5 PE စာရွက်သည် Read 1၊ Index 1 နှင့် Read 2 အတွက် စိတ်ကြိုက် sequencing primer များကို အသုံးပြု၍ စီစစ်ခြင်း MiSeq သည် Index 5 ကိုဖတ်ရန်အတွက် sequencing primer အဖြစ် P2 primer ကိုအသုံးပြုသောကြောင့် MiSeq စနစ်အတွက် TELL-Seq™ စိတ်ကြိုက် Index 2 primer မလိုအပ်ပါ။ စုစည်းထားသည့် မည်သည့်စာကြည့်တိုက်များကိုမဆို demultiplexing သည် s ပေါ်တွင် အခြေခံမည်ဖြစ်သည်။ample အညွှန်း (ဆိုလိုသည်မှာ အညွှန်းကိန်း 2)။ sequencing run ပြီးသည်နှင့် ၎င်းကို TELL-read analysis pipeline မှ သီးခြားစီ လုပ်ဆောင်ပါမည်။
Illumina® Sequencing အရှည်ဖတ်ရန် ထောက်ခံချက်
- တွဲထားသော အဆုံး အတွဲလိုက်ကို အကြံပြုထားသည်။
- TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက် အညွှန်းကိန်း 1 သည် 18 အခြေခံ၊ အညွှန်း 2 သည် 8-base (T-series) သို့မဟုတ် 10-base (C-series) ဖြစ်သည်။ အညွှန်းနှစ်ခုလုံးအတွက် စုစုပေါင်း 26-base (T-series) သို့မဟုတ် 28-base (C-series) ရှိပြီး စံ Illumina dual အညွှန်းအတွက် စုစုပေါင်း 16-base နှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါသည်။
- TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်အညွှန်းကို စီစစ်ရန်အတွက် လိုအပ်သည့် အပို 10-cycle ကို read 1 မှနုတ်ယူကာ 2 sequencing cycles အညီအမျှဖတ်ရန် လိုအပ်သည်။ Illumina sequencing reagent သည် အပိုသံသရာ 2 ခုကို အာမခံသောကြောင့်၊ read 4 အတွက် 1-cycle နှင့် read 4 အတွက် 2-cycle ကို အသီးသီး နှုတ်ထားရန် လိုအပ်ပါသည်။
- အကြံပြုထားသော sequencing length သည် 2×96 PE မှ 2×146 PE ဖြစ်သည် s တစ်ခုတည်းအတွက် 2×100 PE မှ 2×150 PEampIndex 2 ကိုဖတ်စရာမလိုဘဲ le run ပါ။
Sequencing Depth ထည့်သွင်းစဉ်းစားခြင်း။
- TELL Bead လွှမ်းခြုံမှု လုံလောက်စွာ ရရှိရန် လုံလောက်သော စီတန်းခြင်း အတိမ်အနက် လိုအပ်ပါသည်။ စာကြည့်တိုက်တွင် TELL ပုတီးစေ့ကို များများသုံးလေလေ ampTELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်ကို ဖန်တီးရန် lification၊ လိုချင်သော sequencing အတိမ်အနက်ကို ရရှိရန် စီစစ်ဖတ်မှုများ ပိုမိုလိုအပ်ပါသည်။ သို့သော် စာကြည့်တိုက်အတွက် အသုံးပြုသည့် TELL ပုတီးစေ့ အနည်းငယ်သာရှိသည်။ amplification၊ စာကြည့်တိုက်ရှုပ်ထွေးမှု နည်းပါးလေလေ၊ ဆက်တိုက်ဖတ်ခြင်း၏ ထပ်တူပွားနှုန်း မြင့်မားလာနိုင်သည်။ TELL Beads အသုံးပြုထားသည့် ချိန်ခွင်လျှာနှင့် TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်အတွက် လိုအပ်သော ရှုပ်ထွေးမှုသည် ဂျီနိုမ်အရွယ်အစားနှင့် အက်ပ်လီကေးရှင်းပေါ်တွင် မူတည်ပါသည်။
- de novo assembly application အတွက်၊ s ၏ အနည်းဆုံး 60x genome coverageample ကိုယေဘုယျအားဖြင့်အကြံပြုသည်။ သို့သော်၊ စာကြည့်တိုက်အတွက်အသုံးပြုသည့် TELL Beads ပမာဏပေါ်မူတည်၍ နိမ့်သော sequencing လွှမ်းခြုံမှုလည်း လုံလောက်နိုင်ပါသည်။ amplification နှင့် TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်ရှုပ်ထွေးမှု။
- လူသားအဆင့်ဆင့်အတွက်၊ တစ်စက္ကန့်လျှင် အနည်းဆုံး အစုလိုက် သန်း 500 ဖတ်သည်။amp40x အတိမ်အနက်ရှိသော le ကိုအကြံပြုထားသည်။
- ပစ်မှတ်ထားသော အတွဲလိုက်အတွက်၊ အနည်းဆုံး 100x လွှမ်းခြုံမှုကို အကြံပြုထားသည်။
Library Multiplex Primer Index Sequences (ဆိုလိုသည်မှာ Index 2 Read)- T-series (8-base)
| စာကြည့်တိုက် Multiplex
Primer (T-series) |
S အတွက်ample Sheet MiSeq | S အတွက်ample Sheet NovaSeq၊
NovaSeq X၊ NextSeq၊ MiniSeq |
| T501 | TGAACCT | AAGGTTCA |
| T502 | TGCTAAGT | အက်TAGCA |
| T503 | TGTTTCT | AGAGAACA |
| T504 | TAAGACAC | GGTCTTA |
| T505 | CTAATCGA | TCGATTAG |
| T506 | CTAGAACA | TGTTCTAG |
| T507 | TAAGTTCC | GGAACTTA |
| T508 | TAGACCTA | TAGGTCTA |
| T509 | CATCCGAA | TTCGGATG |
| T510 | TTATGAGT | ACTCATAA |
| T511 | AGAGGCGC | GCGCCTCT |
| T512 | TAGCCGCG | CGCGGCTA |
| T513 | ACGAATAA | TTATTCGT |
| T514 | TTCGTAGG | CCTACGAA |
| T515 | GATCTGCT | AGCAGATC |
| T516 | CGCTCCGC | GCGGAGCG |
| T517 | AGGCTATA | TATAGCCT |
| T518 | GCCCTAT | ATAGAGGC |
| T519 | AGGATAGG | CCTTCCT |
| T520 | TCAGAGCC | GGCTCTGA |
| T521 | CTCGCCT | AGGCGAGAG |
| T522 | တအာဂတ္တ | TAATCTTA |
| T523 | AGTAAGTA | ပညာအရည်အချင်း |
| T524 | GACTTCCT | AGGAAGTC |
Library Multiplex Primer Index Sequences (ဆိုလိုသည်မှာ Index 2 Read)- C,D,E,F-series (10-base)
| Library Multiplex Primer (C-series) | S အတွက်ample Sheet MiSeq | S အတွက်ample Sheet NovaSeq၊ NovaSeq X၊ NextSeq၊ MiniSeq |
| C501 | ACGTACGTAC | GTACGTACGT |
| C502 | CATGCATGCA | TGCATGCATG |
| C503 | GTACGTACGT | ACGTACGTAC |
| C504 | TGCATGCATG | CATGCATGCA |
| C505 | ATGCTGATCA | TGATCAGCAT |
| C506 | CACAGCTGTG | CACAGCTGTG |
| C507 | GCTGATCAGC | GCTGATCAGC |
| C508 | TGATCAGCAT | ATGCTGATCA |
| C509 | ဆွဲဆောင်မှု | AGTATTGAAT |
| C510 | CTAGCGCTAG | CTAGCGCTAG |
| C511 | GCTAGTAGTA | TACTACTAGC |
| C512 | TCCAATCAAG | CTTGATTGGA |
| C513 | AATATTGCTG | CAGCAATATT |
| C514 | CGTCGTTACG | CGTAACGACG |
| C515 | GATTGATTCC | GGAATCAATC |
| C516 | TCTAACAATG | CATTGTTAGA |
| C517 | AGAATTGTCA | TGACAATTTCT |
| C518 | CTCAGCAATT | AATTGCTGAG |
| C519 | GGTCCTTGTC | GACAAGGACC |
| C520 | AGCGCTGACA | TGTCAGGCCT |
| C521 | CTCCTAGTGG | CCACTAGGAG |
| C522 | GTTACAGCT | AGCTGTAACC |
| C523 | CTGATTGGCG | CGCCAATCAG |
| C524 | ATTGGTTAGA | TCTAACCAAT |
| C525 | CCATTCAACT | AGTTGAATGG |
| C526 | CAGTATTGAC | GTCAATACTG |
| C527 | GAGTCCTCAA | TTGAGGACTC |
| C528 | AGCTACTACT | AGTAGTAGCT |
| C529 | TAGCTAGCGC | GCGCTAGCTA |
| C530 | GATGCAACAC | GTGTTGCATC |
| C531 | CCTCAGTACA | TGTACTGAGG |
| C532 | CGGTAATTCA | TGAATTACCG |
| C533 | CGCAATGGCT | AGCCATGCG |
| C534 | GTACGTTGAA | TTCAACTAC |
| C535 | TTGATCAGTA | TACTGATCAA |
| C536 | GGCCTAACAA | TTGTTAGGCC |
| C537 | GTTGTTGGAA | TTCCAACAAC |
| C538 | TACGTTGGAC | GTCCAACGTA |
| C539 | ACACCATGCA | TGCATGGTGT |
| C540 | GCAATAGTAC | GACTATTTGC |
| C541 | ACGCAGCCAG | CTGGCTCGGT |
| C542 | CGAGTTGACG | CGTCAACTCG |
| C543 | CGTGGCTGAA | TTCAGCCACG |
| C544 | TCTCAAGGAC | GTCCTTGAGA |
| C545 | CCTAGGCACT | AGTGCCTAGG |
| C546 | CTCGGTAAT | ATTACCGCAG |
| C547 | GGCACTACCA | TGGTAGTGCC |
| C548 | GCTCAATCAA | TTGATTGAGC |
| C549 | AGGCACACAC | GTGTGTGCCT |
| C550 | CCTGGCAAGA | TCTTGCCAGG |
| C551 | TAATTGGTAG | CTACCAATTA |
| C552 | GCCAAACAAGT | ACTGTTGGC |
| C553 | ATGCGTTATA | TATAAGCCAT |
| C554 | GCATGGCCTT | AAGGCCATGC |
| C555 | ACAATACTGG | CCAGTATTGT |
| C556 | GGATTGGACT | AGTCCAATCC |
| C557 | ACTGTACTAT | ATAGTACAGT |
| C558 | CAGCTGTGAG | CTCACAGCTG |
| C559 | CTTGAGGACC | GGTCCTCCAAG |
| C560 | GGTACAATAG | CTATTGTACC |
| C561 | CTGACTACTA | TAGTAGTCAG |
| C562 | TCAACCATGG | CCATGTTGA |
| C563 | ATTATAACCG | CGGTTATAAT |
| C564 | ACTAGTCCTT | AAGGACTAGT |
| C565 | ACTGGACGT | ACGTCCAAGT |
| C566 | ATGGTTAGGA | TCTAACCAT |
| C567 | AGGTACCAA | TTGGTACCAT |
| C568 | GAATTGACTC | GAGTCAATTC |
| C569 | AGCAACCAGG | CCTGTGTTGCT |
| C570 | TACTGTGCTG | CAGCACAGTA |
| C571 | CAACAACGTC | GACGTTGTTG |
| C572 | CAGTAGCGCT | AGCGCTACTG |
| C573 | ATTACCAATC | GATTGGTAAT |
| C574 | TAAGGACCGC | GCGGTCTTTA |
| C575 | ACACGTACCG | CGGTACGTGT |
| C576 | CACGTTGTT | AAAACGTTG |
| C577 | ATTGTGCTGA | TCAGCACAAT |
| C578 | GTACCAACAG | CTGTTGGTAC |
| C579 | TTGTCAAGGA | TCCTTGACAA |
| C580 | CTTGTTAGTA | TACGTACAAG |
| C581 | TGCCTTGTAA | TTACAAGGCA |
| C582 | TAGTAGCTTA | TAAGCTACTA |
| C583 | GACCGCAATG | CATTGCGGTC |
| C584 | CTACTAGCTT | AAGCTAGTAG |
| C585 | AGCACACGTT | AACGTGTGCT |
| C586 | TGTTATAAGC | GCTTAATACA |
| C587 | GTTGCCAAGT | ACTGGCAAC |
| C588 | CTGGCAACCG | CGGTTGCCAG |
| C589 | TTAGGCCTTA | TAAGGCCTAA |
| C590 | CGCAGCACAG | CTGTGCTGCG |
| C591 | CTAGGCACAA | TTGTGCCTAG |
| C592 | TGTTGTTAAG | CTGTACAACA |
| C593 | CTAACGTGGC | GCCACGTTAG |
| C594 | GCGTACTGGT | ACCAGTACGC |
| C595 | GGCCCTGAATT | AATTCAGGCC |
| C596 | CATGCTCGAG | CTCGAGCATG |
| Library Multiplex Primer (D-series) | S အတွက်ample Sheet MiSeq | S အတွက်ample Sheet NovaSeq၊ NovaSeq X၊ NextSeq၊ MiniSeq |
| D501 | AGCACTGTAA | TTACAGTGCT |
| D502 | CCGAAGTACT | AGTACTTCGG |
| D503 | GTTACAAGTA | TACTGTAAC |
| D504 | TGATTCGGTG | CACGCAATCA |
| D505 | ATCTTAGGCA | TGCCTAAGAT |
| D506 | CACGCAAGTT | AACTTTCGGTG |
| D507 | GAGCTTAGGA | TCCTAAGCTC |
| D508 | TATTGTCGA | TCGAGCAATA |
| D509 | AACATCTGAG | CTCAGATGTT |
| D510 | CAACTCAGCA | TGCTGAGTTG |
| D511 | GAACTATATG | CATATAGTTC |
| D512 | TAATAGTCTA | TAGACTATTA |
| D513 | AAGATTGACG | CGTCAATCTT |
| D514 | CACGTAGCCG | CGGCTACGG |
| D515 | GACTCGATCA | TGATCGAGTC |
| D516 | TAATCCTCCGC | GCGAGGATTA |
| D517 | AAGCTCCTGG | CCAGGAGTTT |
| D518 | CAGATTGTTG | CAACAATCTG |
| D519 | GATGCTATTC | GAATAGCATC |
| D520 | TAATCCTCCGC | GCGAGGATTA |
| D521 | AAGTATACCT | AGGTATACTT |
| D522 | CAGTAGCCAA | TTGGCTACTG |
| D523 | GCAAGGACTC | GAGTCCTTGC |
| D524 | TACTACTGTA | TACAGTAGTA |
| D525 | AATCCTAGCT | AGCTAGGATT |
| D526 | CATTGGCAAG | CTTGCCAATG |
| D527 | GCCTGAGAAT | ATTCTCAGGC |
| D528 | TACTAGCAAG | CTTGCTAGTA |
| D529 | ACAGCTAGTC | GACTAGCTGT |
| D530 | CAACCAGTA | TACTGGTTGG |
| D531 | GCGCTCAATT | AATTGACGGC |
| D532 | TAGCGCGGAC | GTCCGCGCTA |
| D533 | ACCTATAGTT | AACTATAGGT |
| D534 | CCACGTCAGG | CCTGAGTGG |
| D535 | GCTACGCAAT | ATTGCGTAGC |
| D536 | TAGTTGCTGC | GCAGCAACTA |
| D537 | ACGGTACAAC | GTTGTACCGT |
| D538 | CCGAACTTCG | CGAAGTTCGG |
| D539 | GCTCCTAATT | AATTAGGAGC |
| D540 | TTCCTCGAT | ATCGAGGATA |
| D541 | ACTCGATTTCT | AGAATCGAGT |
| D542 | CCTGGTAATT | AATTACCAGG |
| D543 | TCGTAGTTGG | CCAACTAGC |
| D544 | TCAGCAAGGA | TCCTTGCTGA |
| D545 | ACTGGTAGCA | TGCTACCAGT |
| D546 | CGATCAACCT | AGGTTGATCG |
| D547 | GGAAGTAGCA | TGCTACTTTCC |
| D548 | TCAGCTGCGG | CCGCAGCTGA |
| D549 | ACTGGTAGCA | TGCTACCAGT |
| D550 | CGATCAACCT | AGGTTGATCG |
| D551 | GGCAAGATGA | TCATCTTGCC |
| D552 | TCGCCCAATG | CATTGGCGGA |
| D553 | AGAATCTTAT | ATAAGATTTCT |
| D554 | CGCTAGCAAC | GTTGCTAGCG |
| D555 | GGCCTTATAT | ATAAGGCC |
| D556 | TCGAATACTA | TAGTATTCGA |
| D557 | AGCAATGGTA | TACCATTGCT |
| D558 | CGGTCTGATC | GATCAGACCG |
| D559 | GTCCCGCCAT | ATGGCGGACC |
| D560 | TCGAATACTA | TAGTATTCGA |
| D561 | AGCACTGTAA | TTACAGTGCT |
| D562 | CGTACTACCG | CGGTAGTACG |
| D563 | GGTTCATCGG | CCGATGAACC |
| D564 | TCGGAGCTGC | GCAGCTCCGA |
| D565 | AGGACGTTAG | CTAACGTCCT |
| D566 | CGTTGACAAT | ATTGTCAACG |
| D567 | GTACTGACAC | GTGTCAGTAC |
| D568 | TCTAAGATAG | CTATCTTAGA |
| D569 | AGTGCTCAAC | GTTGAGCACT |
| D570 | CTAAGAACCT | AGGTTTCTTAG |
| D571 | GTATAATTAC | GTATTATAC |
| D572 | TGATTCGGTG | CACGCAATCA |
| D573 | ATATTCGACG | CGTCGAATAT |
| D574 | CTATAACGAC | GTCGTTATAG |
| D575 | GTCGTTAGGT | ACCTAACGAC |
| D576 | TGCCACTGAT | ATCAGTGGCA |
| D577 | ATCGGCTAG | CTTAGCCGAT |
| D578 | CTCAAGTTGC | GCAACTGAG |
| D579 | GTGTGTTCGA | TCGAACACAC |
| D580 | TGCTATAGTC | GACTATAGCA |
| D581 | အံသြစရာ | AATAGCTCAT |
| D582 | CTCACAACGA | TCGTTGTGAG |
| D583 | TGCTCGATG | CAATCGAGCA |
| D584 | ATGTTGGACT | AGTCCAACAT |
| D585 | CTGATGTTAG | CTAACATCAG |
| D586 | TGGTAACCAG | CTGTGTTACCA |
| D587 | ATTCGAAGTA | TACTTCGAAT |
| D588 | CTTAGCTCCT | AGGAGCTAG |
| D589 | TGTAATCGAT | ACGATTACA |
| D590 | CTTGGACTTC | GAAGTCCAAG |
| D591 | TGTACTTGAA | TTCAAGTACA |
| D592 | TTAAGCTCAG | CTGACGTTAA |
| D593 | TTACAACCAG | CTGTGTTGTAA |
| D594 | TTTCAGCCCA | TGGCTGAGAA |
| D595 | TTGCATGGCT | AGCCATGCAA |
| D596 | TTGGCGGTAC | GTACCGCCAA |
| Library Multiplex Primer (E-series) | S အတွက်ample Sheet MiSeq | S အတွက်ample Sheet NovaSeq၊ NovaSeq X၊ NextSeq၊ MiniSeq |
| E501 | AGCCCCGTC | GACCGTGGCT |
| E502 | CCCCGTGAGT | ACTAGGCGG |
| E503 | GTTATACC | GGTATAAC |
| E504 | CTTCCTGGCA | TGCCAGGAAG |
| E505 | ACGAATTGC | GCAATTCGAT |
| E506 | CACGTGTTGT | ACAACACGTG |
| E507 | GAGCTGTGTT | AACACAGCTC |
| E508 | TTTACAGAT | ATTGTAATA |
| E509 | AACAATGGCG | CGCCATGTT |
| E510 | CAACTCGCTA | TAGCGAGTTG |
| E511 | GAATTGCTCA | TGAGCAATTC |
| E512 | GTGTGTTCGA | TCGAACACAC |
| E513 | CGATTCGAGC | GCTCGAATCG |
| E514 | GTCAACTTA | TAACGTTGAC |
| E515 | GACAATCCTA | TAGGATTGTC |
| E516 | တတ်မြောက်မှု | AGCTGATTA |
| E517 | AGCTTAAT | ATAAGCTTT |
| E518 | CATATTGTAA | TTACAATATG |
| E519 | GATAGGACTT | AAGTCCTATC |
| E520 | ATGCTAGGTT | AACCTAGCAT |
| E521 | GCAAGATTAG | CTAATCTTGC |
| E522 | CAGCTGTATA | TATACAGCTG |
| E523 | GCAAGTCTAA | TTAGACTTGC |
| E524 | TACTAGCAAG | CTTGCTAGTA |
| E525 | AATACTGTTA | TAACAGTATT |
| E526 | CatATCTGAC | GTCAGATATG |
| E527 | GCCACTAGG | CCTTAGTGGC |
| E528 | CTGGCAATTC | GAATTGCCAG |
| E529 | ACAATAGGCG | CGCCTATTGT |
| E530 | CATGCTAG | CTTAGCATGG |
| E531 | GCGAGCGATC | GATCGCTCGC |
| E532 | TAGGTAGTTC | GAACTACTA |
| E533 | ACCTTGGACC | GGTCCAAGGT |
| E534 | TGACTAATAC | GTATTAGTCA |
| E535 | GCTATATCTG | CAGATATAGC |
| E536 | TCTAGTTCAG | CTGAACTAGA |
| E537 | ACGGTTGAGA | TCTCAACCGT |
| E538 | CTGATTCCGG | CCGGAATCAG |
| E539 | TGGTAACCAG | CTGTGTTACCA |
| E540 | GACTCAGACA | TGTCTGAGTC |
| E541 | TTAGCCAATA | TATTGGCTAA |
| E542 | CCTAAGGCG | CGCCTTAGG |
| E543 | CGTAGCAATC | GATTGCTACG |
| E544 | CATGGCTAAT | ATTAGCCATG |
| E545 | ACTCGACAAT | ATTGTCGAGT |
| E546 | CGAGTCTAGG | CCTAGACTCG |
| E547 | GGACTCAGCT | AGCTGAGTCC |
| E548 | TCAGCAAGGA | TCCTTGCTGA |
| E549 | CGATTCCTTA | TAAGGAATCG |
| E550 | ATTAGGCAAT | ATTGCCTAAT |
| E551 | TTGTGAAGG | CCTTCGACAA |
| E552 | TCCAAGTAGC | GCTACTTGGA |
| E553 | AGATAGTCCG | CGGACTATCT |
| E554 | CGCTACATA | TATGTTAGCG |
| E555 | GGCTAATTGT | ACAATTAGCC |
| E556 | AGGTACGTCA | TGAGTACCT |
| E557 | TTCCAAGTTC | GAACTTGGAA |
| E558 | CGGAGCTCCG | CGGAGCTCCG |
| E559 | GGTACTAATA | TATTAGTACC |
| E560 | TCGAAGGCAA | TTGCCTTTCGA |
| E561 | CTCCTTGATG | CATCAAGGAG |
| E562 | GCAATTCCGG | CCGGAATTGC |
| E563 | ACTACGCAGC | GCTGCGTAGT |
| E564 | AGGAATGGCC | GGCCATTCCT |
| E565 | AGGTTAGCAT | ATGCTACCT |
| E566 | CGTCCTAGAC | GTCTAGGACG |
| E567 | CGGTGGCAAT | ATTGCCACGC |
| E568 | TCTGACGAC | GTCGATCAGA |
| E569 | AGTTGTCAGG | CCTGACAACT |
| E570 | CTACCCCAAT | ATTGGCGTAG |
| E571 | GTAGTTCGGT | ACGCAACTAC |
| E572 | TGAGCGCTAT | ATAGCGCTCA |
| E573 | ATACCTTAGT | ACTAGGTAT |
| E574 | GCACACCATT | AATGGTGTGC |
| E575 | GTTAAGGAG | CTCCTTAGAC |
| E576 | CATTCCGCGG | CCGCGGAATG |
| E577 | GCGTACCTAG | CTAGGTCGC |
| E578 | CTCAATAGCA | TGCTATTTGAG |
| E579 | GTGCTAGCC | GGCTTAGCAC |
| E580 | TGCCACTATC | GATAGTGGCA |
| E581 | GCTGTTGAAT | ATTCAACAGC |
| E582 | CGGCTAATCC | GGATTAGCCG |
| E583 | AACTACCGCA | TGCGGTAGTT |
| E584 | ATGCATTACAG | CTTGATGCAT |
| E585 | CTGACTTGCA | TGCAAGTCAG |
| E586 | TGGTACCTAT | ATAGGTACCA |
| E587 | ATTAGCTAAC | GTTAGCTAAT |
| E588 | TGGTACCTAT | ATAGGTACCA |
| E589 | TGTTGTTACC | GGTAGCAACA |
| E590 | CTTATATAG | CTTATATAG |
| E591 | TCAGACTGT | ACAGACTTGA |
| E592 | TGAGCGCTAT | ATAGCGCTCA |
| E593 | TTAGGCGTAC | GTACGCCTAA |
| E594 | TCTCATCAG | CTGATGGAA |
| E595 | CTAGGTATTG | CAATACCTAG |
| E596 | TTGCTGACTA | TAGTCAGCAA |
| Library Multiplex Primer (F-series) | S အတွက်ample Sheet MiSeq | S အတွက်ample Sheet NovaSeq၊ NovaSeq X၊ Next Seq၊ MiniSeq |
| F501 | AGCCAGTAGC | GCTACTGGCT |
| F502 | CCGAGAGTT | AACTCATCGG |
| F503 | GTTCAACTTC | GAAGTTGAAC |
| F504 | TTGAGCATCA | TGATGCTCAA |
| F505 | ATCAACAGTG | CACTGTTGAT |
| F506 | CACACGGTAG | CTACCGTGTG |
| F507 | GAGGATTGCT | AGCAATCCTC |
| F508 | TATTTGGCC | GGCCAGATA |
| F509 | AACTAGTGGC | GCCACTAGTT |
| F510 | CAATCTGGT | ACCAGGATTG |
| F511 | GAAGGTTACG | CGTAACCTTC |
| F512 | CTAAGAACCT | AGGTTTCTTAG |
| F513 | CACACGGTAG | CTACCGTGTG |
| F514 | AATTAGTCTG | CAGACTAATT |
| F515 | GACCGTGTTA | TAACCGGTC |
| F516 | TAATTCGAGG | CCTCGAATTA |
| F517 | AAGATTGACG | CGTCAATCTT |
| F518 | CAACTCGCTA | TAGCGAGTTG |
| F519 | GATTCGAACT | AGTTCGAATC |
| F520 | GCCTTGAGTT | AACTCAAGGC |
| F521 | CACAGATTAG | CTAATCTGTG |
| F522 | CAGCTAGGCC | GGCCTAGCTG |
| F523 | GCAAGGTATA | TATACCTTGC |
| F524 | TACCTAGGTA | TACCTAGGTA |
| F525 | AATCCTTGAA | TTCAAGGATT |
| F526 | CTCGAACCT | AGTTCGATG |
| F527 | GCCTGCGTAA | TTCGCAGGC |
| F528 | CTCGAACCT | AGTTCGATG |
| F529 | ACAGTGCCAT | ATGGCACTGT |
| F530 | CCAACTATTG | CAATAGTTGG |
| F531 | GCGTACCGCA | TGCGGTACGC |
| F532 | TAGGAGCGAT | ATCGCTCCTA |
| F533 | ACCAATTGGT | ACCAATTGGT |
| F534 | AATACTGTTA | TAACAGTATT |
| F535 | GCTGTTGAAT | ATTCAACAGC |
| F536 | TTACAACCAG | CTGTGTTGTAA |
| F537 | ACGTCAAGTC | GACTTGACTT |
| F538 | CAATTCAATG | CATTGAATTG |
| F539 | TGAATTCAGC | GCTGAATTCA |
| F540 | ACGTACAGCT | AGCTGTACGT |
| F541 | TGACTACCAT | ATGGTAGTCA |
| F542 | CCTGGTGTGA | TCACACCAGG |
| F543 | GACTAATCGC | GCGATTAGTC |
| F544 | ACGTTAGTGC | GCACTACGT |
| F545 | ACTCGATTTCT | AGAATCGAGT |
| F546 | CGACAAGATT | AATCTTGTCG |
| F547 | GGAATTGGCT | AGCCAATTCC |
| F548 | TCACAGCCGA | TCGGCTGTGA |
| F549 | CTGTACTGTA | TACAGTACAG |
| F550 | TCGCTCGAGG | CCCGAGCGA |
| F551 | ACCTTAGCAA | TTGCTAGGT |
| F552 | TCCGGACTAC | GTAGTCCGGA |
| F553 | AGAACTTGCA | TGCAAGTTCT |
| F554 | CGCAGGACTT | AAGTCCTGCG |
| F555 | GGCAAGATGA | TCATCTTGCC |
| F556 | GCCTAGCGCG | CGCGCTAGGC |
| F557 | GACATCGCTA | TAGCGATGTC |
| F558 | CGGCTAATCC | GGATTAGCCG |
| F559 | GGTTGAGCTTT | AAGCTCAACCC |
| F560 | TCGCTAGGC | GCCTGAGCGA |
| F561 | GCTGATTATA | TATAATTAGC |
| F562 | GCGCTAGTCC | GGACTAGCGC |
| F563 | TATGTCTGAA | TTCAGACATA |
| F564 | AGCTTAAT | ATAAGCTTT |
| F565 | AGGAATGGCC | GGCCATTCCT |
| F566 | CGTAGCGCGC | GCGCGCTACG |
| F567 | GCCTGCGTAA | TTCGCAGGC |
| F568 | TCTTAGCGAT | ATCGCTAAGA |
| F569 | AGTTCTAAGA | TCTTAGAACT |
| F570 | CTAGGTATTG | CAATACCTAG |
| F571 | GTAGTACTAC | GTAGTACTAC |
| F572 | TGACAAGTAG | CTACTTTGTCA |
| F573 | ATAGTCTGAG | CTCAGACTAT |
| F574 | CTGTGTTACA | TGTAACACAG |
| F575 | GTCTAGCCAC | GTGGCTAGAC |
| F576 | AATCAAGGTT | AACCTTGATT |
| F577 | CATAATTATG | CATAATTATG |
| F578 | CCGAGCTAT | ATAGCTCGAG |
| F579 | GTGCCTGATG | CATCAGGCAC |
| F580 | TGCTCGATG | CAATCGAGCA |
| F581 | GATTCGAACT | AGTTCGAATC |
| F582 | TCGTTGAGGA | TCCTCAACGA |
| F583 | AGCCAGCGGT | ACCGCTGGCT |
| F584 | ATGTCAGATT | AATCTGACAT |
| F585 | CTGTATATAC | GTATATAG |
| F586 | TGGTGTCAAC | GTTGACACCA |
| F587 | ATTGCATGCT | AGCATGCAAT |
| F588 | AGTATTCATA | TATGAATACT |
| F589 | TGTAATTCCG | CGGAATTACA |
| F590 | CTTCCTGGCA | TGCCAGGAAG |
| F591 | TCCGCGCGGA | TCCGCGCGGA |
| F592 | CACTGTTTCGG | CCGAACAGTG |
| F593 | TTAGCCAATA | TATTGGCTAA |
| F594 | TTCGAGCTGA | TCAGCTCGAA |
| F595 | GTACCGCGCG | CGCGCGGTAC |
| F596 | TTGAGCATCA | TGATGCTCAA |
နောက်ဆက်တွဲ
TELL-Seq™ စိတ်ကြိုက် Primers များကို Illumina® Sequencing Primers များအဖြစ် ဖြန့်ချခြင်း။
TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များသည် Illumina sequencing platforms အတွက် စိတ်ကြိုက် sequencing primers လိုအပ်ပါသည်။ PhiX ထိန်းချုပ်မှုစာကြည့်တိုက် သို့မဟုတ် TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များနှင့်အတူ အခြားသော စံသတ်မှတ်ချက်ဖြစ်သော Illumina စာကြည့်တိုက်များအပါအဝင် TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များပါ၀င်သောအခါတွင် စံ Illumina sequencing primers များထဲသို့ စိတ်ကြိုက် TELL-Seq™ Illumina sequencing primers များကို ပေါင်းစပ်ခြင်း လိုအပ်ပါသည်။
မှတ်ချက်- TELL-Seq™ Index 1 တွင် 18-base ပါရှိပြီး 18-cycle sequence လိုအပ်ပါသည်။ Index 2 တွင် T- series primer အတွက် 8-base နှင့် C-series primer အတွက် 10-base ရှိသည်။
စိတ်ကြိုက် primers များကို Illumina primers များထဲသို့ တိုးထည့်ရန် လုပ်ငန်းစဉ်
- ပလက်ဖောင်းတစ်ခုစီအတွက် ယမ်းတောင့်အနေအထား၊ စုစုပေါင်းပမာဏနှင့် စိတ်ကြိုက် primers များ၏ နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုကို အောက်ပါဇယားများတွင် ဖော်ပြထားသည်။
- ကျည်တောင့်အတွင်းရှိ စိတ်ကြိုက် primer ၏ နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုကို အခြေခံ၍ Illumina primer ကျည်တောင့်အနေအထားသို့ ထည့်ရန် စိတ်ကြိုက် primer ၏ ပမာဏကို တွက်ချက်ပါ။*
- စိတ်ကြိုက် primer ကို နှပ်ပြီးနောက်၊ pipette ကို စုစုပေါင်း ထုထည်၏ တစ်ဝက်သို့ ချိန်ညှိပြီး နှိုက်နှိုက်ချွတ်ချွတ် ရောမွှေရန် ငါးကြိမ် အပေါ်သို့ ပိုက်ဆက်ကို ညင်သာစွာ နှိပ်ပါ။
- MiSeq၊ MiniSeq၊ NextSeq နှင့် NovaSeq ပလပ်ဖောင်းများအတွက်၊ s ရှိ "စိတ်ကြိုက် primer" အကွက်အနေအထားကို မစစ်ဆေးပါနှင့်။ample sheet သို့မဟုတ် run setup လုပ်နေစဉ်။
* ရေတွင်းထဲသို့ စိတ်ကြိုက် primer မည်မျှပေါက်မည်ကို တွက်ချက်ရန်၊ (C1)*(V1) = (C2)*(V2) ညီမျှခြင်းနေရာတွင်-
- C1 = 100μM (100μM မြင့်မားသော အာရုံစူးစိုက်မှု primer စတော့ရှယ်ယာကို အသုံးပြုသောအခါ၊ နောက်ဆုံး volume သို့ သေးငယ်သော အပိုပမာဏသည် နည်းပါးသည်)။
- V1 = စိတ်ကြိုက် primer ၏ ထုထည်ပမာဏအတွက် ဖြေရှင်းချက်
- C2 = V2 အောက်တွင်ဖော်ပြထားသောဇယားမှအကြံပြုထားသောစိတ်ကြိုက် primer နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှု = အောက်ပါဇယားများရှိ Illumina primer စုစုပေါင်းပမာဏ
ExampMiSeq ပလပ်ဖောင်းအတွက် le
100μM * V1 = 0.5μM * 680μL V1 = 3.4 µl
အရေးကြီးမှတ်ချက်- အောက်ဖော်ပြပါ လမ်းညွှန်ချက်များသည် လက်ရှိ primer volumes များကို အခြေခံထားသည်။ တိကျသေချာစေရန်၊ စနစ်ထည့်သွင်းမှုမလုပ်ဆောင်မီ ယမ်းတောင့်အတွင်းရှိ စုစုပေါင်း primer ပမာဏကို pipette ဖြင့်တိုင်းတာပါ။
Illumina® sequencer တစ်ခုစီတွင် ကွဲပြားသော နောက်ဆုံး အာရုံစူးစိုက်မှု နှင့် စုစုပေါင်း ပမာဏ ရှိသည် ထို့ကြောင့် သင့်လျော်သော TELL-Seq™ Illumina® Sequencing Primers ပမာဏကို တိုက်ရိုက် ထည့်သွင်းထားကြောင်း သေချာစေရန် အောက်တွင် စာရွက်စာတမ်းကို ကိုးကားပါ။
*မှတ်ချက်: Index 1 နှင့် Index 2 ကို Read 1 နှင့် Read 2 ပါ၀င်သော primers များနှင့်အတူ မကြာခဏ reagent cartridge တွင် ကောင်းစွာပေါင်းစည်းထားပါသည်။ ရေတွင်းအတွက် နောက်ဆုံးအာရုံခံ စိတ်ကြိုက် primer သည် primer တစ်ခုစီ၏ (ဥပမာ။ Index 0.3 ၏ 1μM နှင့် Index 2 စုစုပေါင်း 0.6μM အတွက်) သေချာပါစေ။
<https://knowledge.illumina.com/library-preparation/general/library-preparation-general-reference_material-list/000001542>
အောက်တွင်ဖော်ပြထားသည်။
iSeq100
iSeq100 ကျည်တောင့်တည်ဆောက်မှုကြောင့် စိတ်ကြိုက် primer များကို တင်၍ အသုံးပြုရန် မဖြစ်နိုင်ပါ။
MiniSeq
NextSeq
MiSeq
* နမူနာသည် စီးဆင်းဆဲလ်၏မျက်နှာပြင်ပေါ်တွင် ပုံဖော်ထားသော P2 primer ကိုအသုံးပြုထားသောကြောင့် စိတ်ကြိုက်အညွှန်း 5 (i5) primer အတွက် ရွေးချယ်စရာမရှိပါ။
HiSeq 1000/2000 – 1500/2300 
* နမူနာသည် စီးဆင်းဆဲလ်၏မျက်နှာပြင်ပေါ်တွင် ပုံဖော်ထားသော P2 primer ကိုအသုံးပြုထားသောကြောင့် စိတ်ကြိုက်အညွှန်း 5 (i5) primer အတွက် ရွေးချယ်စရာမရှိပါ။
HiSeq 3000/4000
NovaSeq v1.0 စားသုံးနိုင်သောပစ္စည်းများ
| Kit ဗားရှင်း | Illumina Primer (အမည်) | Cartridge အနေအထား | စုစုပေါင်း အတွဲ (မီလီဂရမ်) | စိတ်ကြိုက် primer နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှု (µM) |
|
SP 100/200/300/500 သံသရာ |
1 ကိုဖတ်ပါ (BP10) | 24 | 4 | 0.3 |
| အညွှန်း 1 (i7) (BP14)* | 23 | 5 | 0.3 | |
| 2 ကိုဖတ်ပါ (BP11) | 13 | 2 | 0.3 | |
|
S1 နှင့် S2 100/200/300 သံသရာ |
1 ကိုဖတ်ပါ (BP10) | 24 | 4 | 0.3 |
| အညွှန်း 1 (i7) (BP14)* | 23 | 5 | 0.3 | |
| 2 ကိုဖတ်ပါ (BP11) | 13 | 2 | 0.3 | |
|
S4 200/300 သံသရာ |
1 ကိုဖတ်ပါ (BP10) | 24 | 7.3 | 0.3 |
| အညွှန်း 1 (i7) (BP14)* | 23 | 5 | 0.3 | |
| 2 ကိုဖတ်ပါ (BP11) | 13 | 3.5 | 0.3 |
* နမူနာသည် စီးဆင်းဆဲလ်၏မျက်နှာပြင်ပေါ်တွင် ပုံဖော်ထားသော P2 primer ကိုအသုံးပြုထားသောကြောင့် စိတ်ကြိုက်အညွှန်း 5 (i5) primer အတွက် ရွေးချယ်စရာမရှိပါ။
NovaSeq v1.5 စားသုံးနိုင်သောပစ္စည်းများ
| Kit ဗားရှင်း | Illumina Primer (အမည်) | Cartridge အနေအထား | စုစုပေါင်း အတွဲ (မီလီဂရမ်) | စိတ်ကြိုက် primer နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှု (µM) |
|
SP 100/200/300/500 သံသရာ |
1 ကိုဖတ်ပါ (VP10) | 24 | 4 | 0.3 |
| အညွှန်း 1 (i7) နှင့် အညွှန်း 2 (i5) (VP14) | 23 | 5 | 0.3 | |
| 2 ကိုဖတ်ပါ (VP11) | 13 | 2 | 0.3 | |
|
S1 နှင့် S2 100/200/300 သံသရာ |
1 ကိုဖတ်ပါ (VP10) | 24 | 4 | 0.3 |
| အညွှန်း 1 (i7) နှင့် အညွှန်း 2 (i5) (VP14) | 23 | 5 | 0.3 | |
| 2 ကိုဖတ်ပါ (VP11) | 13 | 2 | 0.3 | |
|
S4 200/300 သံသရာ |
1 ကိုဖတ်ပါ (VP10) | 24 | 7.3 | 0.3 |
| အညွှန်း 1 (i7) နှင့် အညွှန်း 2 (i5) (VP14) | 23 | 5 | 0.3 | |
| 2 ကိုဖတ်ပါ (VP11) | 13 | 3.5 | 0.3 |
NovaSeq X/X Plus
NextSeq™ 1000/2000 စနစ်တွင် TELL-Seq™ Run ကို စနစ်ထည့်သွင်းခြင်း
NextSeq™ 1000/2000 reagent cartridge တွင် စာကြည့်တိုက်တွင် အနည်းဆုံး စိတ်ကြိုက် primer တစ်ခု လိုအပ်သောအခါ အသုံးပြုရန် စိတ်ကြိုက်ရေတွင်း နှစ်ခု (၁ နှင့် ၂၊ နှစ်ခုလုံးသည် အလွတ်ဖြစ်သည်) ရှိသည်။ ၎င်းသည် စိတ်ကြိုက် primer တစ်ခုစီအတွက် စိတ်ကြိုက် primers (pool) နှစ်ခုအထိ ပံ့ပိုးပေးပါသည်။ Read primer နှင့် Index primer တို့သည် မတူညီသောရေတွင်းများတွင် မရှိမဖြစ်လိုအပ်ပါသည်။
TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များသည် ဖတ်ရှုမှုအားလုံးအတွက် စိတ်ကြိုက် primers လိုအပ်သည် (ဖတ် 1၊ ဖတ် 2၊ အညွှန်း 1 နှင့် အညွှန်း 2)။ TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များကိုသာ လည်ပတ်မှုတွင် စီတန်းထားသည့်အခါ
- TELL-Seq™ read 1 နှင့် primers 2 ခုကို ပေါင်းစပ်ပါ- စိတ်ကြိုက်ဖတ် primer ရောနှောမှုတစ်ခုစီကို 1 µl ကို ရောနှောပြီး 600 µM နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုရရှိစေရန်၊ ဆိုလိုသည်မှာ၊ 0.3 µM ၏ 1.8 µl ၏ TELL-Seq™ ဖတ်ရန် primer 100 နှင့် 1 µM ၏ 1.8 µM 100r ™ ဖတ်ရန် µl HT2။ စိတ်ကြိုက်ရေတွင်းထဲသို့ထည့်ပါ ၁။
- TELL-Seq™ အညွှန်းကိန်း 1 နှင့် အညွှန်းကိန်း 2 ကို ပေါင်းစပ်ပါ- HT1 ကို အသုံးပြု၍ စိတ်ကြိုက်အညွှန်းခံ primer ရောနှောမှုတစ်ခုစီကို 600 µl မှ 0.6 µM နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုရရှိစေရန်၊ ဆိုလိုသည်မှာ 3.6 µM TELL-Seq™ အညွှန်းကိန်း 100 primer နှင့် 1 µ3.6 µM ၏ 100µl ၏ TELL-Primeq™ ၏ 2 µM 593 µl HT1။ ၎င်းကို စိတ်ကြိုက်ရေတွင်းထဲသို့ ထည့်ပါ ၂။
- အောက်ပါအတိုင်း sequencing run ကို သတ်မှတ်သည့်အခါ သင့်လျော်သော စိတ်ကြိုက် primer ကို ရွေးချယ်ပါ။
- 1 ကိုဖတ်ပါ- စိတ်ကြိုက် ၁
- အညွှန်း ၁- စိတ်ကြိုက် ၂
- အညွှန်း ၁- စိတ်ကြိုက် ၂
- 2 ကိုဖတ်ပါ- စိတ်ကြိုက် ၁
PhiX စာကြည့်တိုက်များကို TELL-Seq™ libraries နှင့် run မှုတွင် စီတန်းခြင်းအတွက် အသုံးပြုသောအခါ
- NextSeq 1000/2000 Read Primer Kit (Catalog# 20046117) ရယူပါ
TELL-Seq™ read 1 ကို ပေါင်းစပ်ပြီး HP2 တွင် primer 21 ခုကိုဖတ်ပါ- စိတ်ကြိုက်ဖတ်ပြီးသား primer ရောနှောမှုတစ်ခုစီကို 600 µl HP21 သို့ 0.3 µM နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုအတွက် 1.8 µl၊ ဆိုလိုသည်မှာ၊ 100 µM TELL-Seq™ read 1 primer နှင့် 1.8 µl ၏ TELL100 µl™ တွင် primer 2 µM ကိုဖတ်ပါ။ HP597 ၎င်းကို စိတ်ကြိုက်ရေတွင်းထဲသို့ ထည့်ပါ ၁။- TELL-Seq™ အညွှန်းကိန်း 1 နှင့် အညွှန်းကိန်း 2 ကို ပေါင်းစပ်ပါ- HT1 ကို အသုံးပြု၍ စိတ်ကြိုက်အညွှန်းခံ primer ရောနှောမှုတစ်ခုစီကို 600 µl မှ 0.6 µM နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုရရှိစေရန်၊ ဆိုလိုသည်မှာ 3.6 µM TELL-Seq™ အညွှန်းကိန်း 100 primer နှင့် 1 µ3.6 µM ၏ 100µl ၏ TELL-Primeq™ ၏ 2 µM 593 µl HT1။ ၎င်းကို စိတ်ကြိုက်ရေတွင်းထဲသို့ ထည့်ပါ ၂။
- အောက်ပါအတိုင်း sequencing run ကို သတ်မှတ်သည့်အခါ သင့်လျော်သော စိတ်ကြိုက် primer ကို ရွေးချယ်ပါ။
- 1 ကိုဖတ်ပါ- စိတ်ကြိုက် ၁
- အညွှန်း ၁- စိတ်ကြိုက် ၂
- အညွှန်း ၁- စိတ်ကြိုက် ၂
- 2 ကိုဖတ်ပါ- စိတ်ကြိုက် ၁
Dual Index Illumina စာကြည့်တိုက်များကို TELL-Seq™ စာကြည့်တိုက်များဖြင့် ဆက်တိုက်လုပ်ဆောင်သောအခါ၊
- NextSeq 1000/2000 Read & Index Primer Kit (Catalog# 20046115) ရယူပါ
- TELL-Seq™ read 1 ကို ပေါင်းစပ်ပြီး HP2 တွင် primer 21 ခုကိုဖတ်ပါ- စိတ်ကြိုက်ဖတ်ပြီးသား primer ရောနှောမှုတစ်ခုစီကို 600 µl HP21 သို့ 0.3 µM နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုအတွက် 1.8 µl၊ ဆိုလိုသည်မှာ၊ 100 µM TELL-Seq™ read 1 primer နှင့် 1.8 µl ၏ TELL100 µl™ တွင် primer 2 µM ကိုဖတ်ပါ။ HP597 ၎င်းကို စိတ်ကြိုက်ရေတွင်းထဲသို့ ထည့်ပါ ၁။
- TELL-Seq™ အညွှန်းကိန်း 1 နှင့် အညွှန်းကိန်း 2 ကို BP14 တွင် ပေါင်းစပ်ပါ- စိတ်ကြိုက်အညွှန်းခံ primer ရောနှောမှုတစ်ခုစီကို 600 µl BP14 သို့ 0.6 µM နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုအဖြစ် 3.6 µM နောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုအတွက်၊ ဆိုလိုသည်မှာ၊ 100 µM TELL-Seq™ အညွှန်းကိန်း 1 primer နှင့် 3.6 µM ၏ 100 µl ကို primer ၏ TELL-Seq™ ၏ µl ထဲသို့ထည့်ပါ။ 2 µl BP593။ ၎င်းကို စိတ်ကြိုက်ရေတွင်းထဲသို့ ထည့်ပါ ၂။
- အောက်ပါအတိုင်း sequencing run ကို သတ်မှတ်သည့်အခါ သင့်လျော်သော စိတ်ကြိုက် primer ကို ရွေးချယ်ပါ။
- 1 ကိုဖတ်ပါ- စိတ်ကြိုက် ၁
- အညွှန်း ၁- စိတ်ကြိုက် ၂
- အညွှန်း ၁- စိတ်ကြိုက် ၂
- 2 ကိုဖတ်ပါ- စိတ်ကြိုက် ၁
စာရွက်စာတမ်းများ / အရင်းအမြစ်များ
 |
Universal Sequencing TELL-Seq စာကြည့်တိုက် [pdf] အသုံးပြုသူလမ်းညွှန် TELL-Seq စာကြည့်တိုက်၊ TELL-Seq၊ စာကြည့်တိုက် |
